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Objectivos, Programa, Docente

Objectivos

Pretende-se que o aluno

Programa

  1. Problemas Computacionais em Biologia Molecular
  2. Revis√£o dos Conceitos Fundamentais da Biologia Molecular
    1. DNA
    2. Proteínas
    3. Bases de Dados
  3. Alinhamento de Pares de Sequências
    1. Homologia
    2. Alinhamento Globais: Algoritmo de Needleman e Wunsch
    3. Alinhamento Locais: Algoritmo de Smith e Waterman
    4. Alinhamento para Fun√ß√Ķes de Penaliza√ß√£o Afins
    5. Métodos Heurísticos: BLAST
    6. Modelos para Alinhamentos: BLOSUM
  4. Alinhamentos M√ļltiplos
    1. Avalia√ß√£o de Alinhamentos M√ļltiplos
    2. Alinhamento em Estrela
    3. Alinhamento em √Ārvore: Clustal-W
  5. Modelos Probabílisticos
    1. Conceitos B√°sicos de Probabilidade
    2. Cadeias de Markov
    3. Aplica√ß√Ķes: Encontrar Genes
    4. HMMs
    5. Aprendizagem de HMMs: "Forward-Backward"
    6. Aplica√ß√Ķes: Profile HMMs
  6. √Ārvores Filogen√©ticas
    1. Métodos de Construção
    2. UPGMA
    3. Junção de Vizinhos
    4. Parcimónia
    5. Branch & Bound
  7. Express√£o de Genes
    1. Clustering Hier√°rquico
    2. Clustering por K-Médias
    3. Clustering EM
  8. Estrutura de Proteínas
    1. Níveis de Descrição
    2. Modelação Por Homologia
    3. Threading
  9. Novas √Āreas
    1. Biologia Comparativa
    2. Biologia de Sistemas
    3. Ontologias
    4. Medicina Moleculas

Docente


Vítor Santos Costa, February 8, 2008


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